| Model Parameters for Phylogenetic Analysis | |||||||||||||
| gene/region | polPR | polRT | envC2-V5 | ||||||||||
| model class | GTR+I+G | GTR+I+G | TVM+I+G | ||||||||||
| fA | 0.3784 | 0.45163 | 0.4538 | ||||||||||
| fC | 0.1538 | 0.15032 | 0.1657 | ||||||||||
| fG | 0.2339 | 0.17336 | 0.178 | ||||||||||
| fT | 0.2338 | 0.22468 | 0.2025 | ||||||||||
| RA<->C | 5.80316 | 1.07186 | 1.8604 | ||||||||||
| RA<->G | 20.0989 | 5.31766 | 4.3451 | ||||||||||
| RA<->T | 1.17262 | 0.29502 | 0.696 | ||||||||||
| RC<->G | 0.36115 | 0.53002 | 0.7504 | ||||||||||
| RC<->T | 21.9604 | 7.07181 | 4.3451 | ||||||||||
| RG<->T | 1 | 1 | 1 | ||||||||||
| p-inv | 0.20449 | 0.26509 | 0.1358 | ||||||||||
| gamma shape | 0.5973 | 0.76247 | 0.8454 | ||||||||||